| 实验室名称 | 批准部门 | 批准时间 | 主任 | 联系人 | 联系邮箱 | 所属二级单位 | |
| 国家级 | 生殖医学国家重点实验室 | 科技部 | 2011 | 胡志斌 | 王黎熔 | wanglr72@njmu.edu.cn | 生殖医学国家重点实验室 |
| 环境与人类健康国际联合研究中心 | 科技部 | 2017 | 沈洪兵 | 魏永越 | weiyongyue@126.com | 公共卫生学院 | |
| 肿瘤个体化医学省部共建协同创新中心 | 教育部 | 2020 | 沈洪兵 | 陈佳萍 | jiapingchen@njmu.edu.cn | 公共卫生学院 | |
| 部级 | 江苏省人类生殖调控与危害评估重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地 | 科技部 | 2003 | 沙家豪 | 生殖医学国家重点实验室 | ||
| 现代毒理学教育部重点实验室 | 教育部 | 2005 | 张正东 | 储海燕 | chy_grape@126.com | 公共卫生学院 | |
| 国家卫生健康委员会抗体技术重点实验室 | 国家卫健委 | 2005 | 冯振卿 | 唐奇 | qitang@njmu.edu.cn | 基础医学院 | |
| 生殖医学重点实验室 | 国家卫健委 | 2008 | 沙家豪 | 生殖医学国家重点实验室 | |||
| 中国医学科学院肝移植重点实验室 | 中国医学科学院 （国家卫建委） | 2017 | 王学浩 | 李梦芸 | wangxh@njmu.edu.cn | 第一附属医院 | |
| 省级 | 江苏省医药、农药、兽药安全性评价与研究中心 | 江苏省科技厅 | 1999 | 夏彦恺 | 秦珩 | qh@njmu.edu.cn | 公共卫生学院 |
| 江苏省人类功能基因组学重点实验室 | 2002 | 韩晓 | 常晓嫒 | changxa@njmu.edu.cn | 基础医学院 | ||
| 江苏省医药动物实验基地 | 2008 | 施爱民 | 张珂 | zhangke@njmu.edu.cn | 动物中心 | ||
| 江苏省异种移植重点实验室 | 2012 | 戴一凡 | 李琳 | smile.lea@hotmail.com | 基础医学院 | ||
| 江苏省临床研究与循证医学中心 | 2021 | 陈峰 | 梁宁霞 | 第一附属医院 | |||
| 江苏省基因表达工程研究中心 | 江苏省发展和改革委员会 | 2001 | 韩晓 | 基础医学院 | |||
| 江苏省区域卫生信息化工程中心 | 2009 | 张竹繁 | 阚宏宇 | hykan@njmu.edu.cn | 信网中心 | ||
| 江苏省心血管病诊疗器械与设备工程实验室 | 2015 | 孔祥清 | 彭澎 | 第一附属医院 | |||
| 江苏省远程移动互联网医疗工程中心 | 2016 | 张定国 | zhdg0223@126.com | 第一附属医院 | |||
| 江苏省智能穿戴监护与康复器械工程研究中心 | 2019 | 李建清 | 刘宾 | sslb_112@hotmail.com | 生物医学工程与信息学院 | ||
| 江苏省口腔转化医学工程研究中心 | 2019 | 徐艳 | 王琰玲 | wyl1280@163.com | 附属口腔医院 | ||
| 江苏省数字医学与3D打印临床工程研究中心 | 2019 | 王黎明 | 姚庆强 | yaoqingqiang@126.com | 南京市第一医院 | ||
| 江苏省抗体药物工程研究中心 | 2020 | 冯振卿 | 唐奇 | 基础医学院 | |||
| 江苏省慢病大数据应用与智慧健康服务工程研究中心 | 2020 | 刘云 | 第一附属医院 | ||||
| 江苏省基因药物技术中心 | 江苏省经济贸易委员会 | 2004 | 朱东亚 | 吴海银 | haiyinwu@njmu.edu.cn | 药学院 | |
| 江苏省心血管防治技术标准创新基地 | 江苏省市场监督管理局 | 2021 | 孔祥清 | 第一附属医院 | |||
| 江苏省应用毒理学重点实验室 | 江苏省教育厅 | 1993 | 张正东 | 储海燕 | chy_grape@126.com | 公共卫生学院 | |
| 江苏省生殖医学重点实验室 | 1997 | 沙家豪 | 生殖医学国家重点实验室 | ||||
| 江苏省现代病原生物学重点实验室 | 2003 | 苏川 | 李娅琳 | dicailyl@njmu.edu.cn | 基础医学院 | ||
| 江苏省神经退行性疾病重点实验室 | 2007 | 胡刚 | 丁建花 | djhyue@njmu.edu.cn | 基础医学院 | ||
| 江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室 | 2010 | 沈洪兵 | 马红霞 | mahongxia@126.com | 公共卫生学院 | ||
| 江苏省心血管病分子干预重点实验室（心血管病靶向干预研究国家重点实验室培育点） | 2010 | 陈琪 | 柏惠 | huibai@njmu.edu.cn | 基础医学院 | ||
| 江苏省口腔疾病研究重点实验室 | 2014 | 王林 | 潘永初 | panyongchu@njmu.edu.cn | 附属口腔医院 | ||
| 江苏省儿童重大疾病研究重点实验室 | 2014 | 张爱华 | 杨莉 | 936095183@qq.com | 附属儿童医院 | ||
| 江苏省心脑血管药物重点实验室 | 2016 | 季勇 | 孙世秀 | sunshixiu@njmu.edu.cn | 药学院 | ||
| 江苏省老年医学重点实验室 | 2016 | 吴剑卿 | 刘莉 | liuli@njmu.edu.cn | 第一附属医院 | ||
| 健康江苏研究院 | 江苏省委 | 2016 | 王长青 | 朱亚 | leola_zhuya@njmu.edu.cn | 医政学院 | |
| 协同创新中心 | 江苏省心血管病转化医学协同创新中心 | 江苏省教育厅 | 2013 | 陈琪 | 柏惠 | huibai@njmu.edu.cn | 基础医学院 |
| 江苏省肿瘤个体化医学协同创新中心 | 2017 | 沈洪兵 | 陈佳萍 | jiapingchen@njmu.edu.cn | 公共卫生学院 |